Le contenu

Filière Écosystèmes microbiens

Agroécologie et fermentation en Bourgogne-Franche-Comté

Un tissu d’entreprises impliquées

Une recherche interdisciplinaire de pointe

Des formations ciblées

Agroécologie + Fermentation = une filière à coordonner

L’agroécologie et la filière des ferments et microbes sont complémentaires pour une alimentation durable !

La Bourgogne-Franche-Comté est un territoire d’excellence à la fois dans le domaine de la fermentation et dans le développement de l’agroécologie. Si ces deux approches sont distinctes, elles peuvent néanmoins se renforcer mutuellement dans une logique de durabilité et de valorisation des productions locales.

L’agroécologie et les microbes (micro-organismes) sont intimement liés, car ces derniers jouent un rôle fondamental dans la santé des sols, la nutrition des plantes et la résilience des écosystèmes agricoles.

 

Voici comment ces deux concepts sont connectés :

  • Microbes et Fertilité des Sols 
    Les bactéries et champignons décomposent la matière organique et libèrent des nutriments essentiels (azote, phosphore, potassium). Les mycorhizes (champignons symbiotiques) améliorent l’absorption des minéraux par les racines des plantes. Certaines bactéries (ex : Rhizobium) fixent l’azote atmosphérique, réduisant ainsi le besoin d’engrais chimiques.
  • Protection Naturelle des Cultures
    Les microbes bénéfiques (ex : Bacillus subtilis, Trichoderma) aident à lutter contre les maladies en inhibant les pathogènes. Certaines bactéries produisent des substances antifongiques ou stimulent les défenses naturelles des plantes.
  • Dégradation des Polluants et Écologie du Sol
    Des micro-organismes du sol aident à la biodégradation des pesticides et polluants. Ils participent au cycle du carbone, réduisant l’empreinte écologique de l’agriculture.
  • Production Agricole et Microbiome des Plantes
    L’agroécologie favorise des pratiques comme le compostage et les cultures associées, qui enrichissent la diversité microbienne. Un microbiome riche et diversifié renforce la résilience des cultures face aux stress environnementaux (sécheresse, maladies).

Un écosystème d’innovation au service de ces dynamiques

La Bourgogne-Franche-comté se distingue par un tissu d’entreprises, de start-ups et d’organismes de recherche engagés dans le développement de l’agroécologie et des technologies de fermentation :

Agroécologie en BFC :
des atouts indéniables pour une production durable

  • Des exploitations engagées dans des pratiques régénératrices (agriculture de conservation, agroforesterie, biodiversité cultivée…),
  • Une valorisation des productions locales à travers des circuits courts,
  • Un accompagnement structuré par les acteurs institutionnels et les pôles de recherche (INRAE, chambres d’agriculture, établissements d’enseignement agricole…),
  • Une dynamique forte autour des labels bio et des signes de qualité (AOP, IGP, Label Rouge).

Fermentation en BFC :
une valorisation des ressources agricoles

La fermentation est un procédé de transformation alimentaire ancestral qui permet de :

  • Prolonger la conservation des aliments sans recours aux additifs chimiques,
  • Valoriser des productions agricoles locales en leur apportant une plus-value (fromages AOP, vins, bières, pains au levain…),
  • Améliorer les qualités nutritionnelles et gustatives des produits,
  • Valoriser les déchets et co-produits,
  • Réduire le gaspillage alimentaire en transformant les surplus de production.

 

Un environnement scientifique et technique de pointe

Les centres de recherche en Bourgogne-Franche-Comté

Logo Institut Agro Dijon

Logo PAM

 

 

 
  • L’UMR Agroécologie de l’INRAE : recherche sur la biodiversité, les interactions biotiques et systèmes de cultures innovants pour des transitions agroécologiques et alimentaires
  • L’UMR CSGA (Centre des Sciences du Goût et de l’Alimentation) de l’INRAE : étude des impacts sensoriels et nutritionnels des produits fermentés
  • L’Institut Agro Dijon : formation et recherche en agroalimentaire et fermentation
  • L’UMR PAM (Procédés Alimentaires et Microbiologiques) de l’Institut Agro : compréhension des phénomènes physiques, chimiques et biologiques qui déterminent la qualité des aliments et du vin pour développer de nouveaux produits et de nouveaux procédés alimentaires
  • Le Laboratoire Chrono-environnement : rattaché à l’Université Marie et Louis Pasteur est une unité mixte de recherche (UMR) sous tutelle CNRS. Il construit son projet scientifique autour des objectifs de l’initiative internationale Future Earth qui promeut l’acquisition des connaissances requises pour un développement planétaire durable.
  • Le Hub d’innovation du PUI-BFC sur la transition agri-alimentaire pour favoriser la mise en réseau des acteurs de la recherche et du monde socio-économique, et le développement des projets d’innovation dans le domaine de la transition agri-alimentaire. Partenaires : INRAE, Université de Bourgogne, CNRS, Institut Agro Dijon, SATT SAYENS et pôle de compétitivité Vitagora.

Les organismes techniques et plateformes

Côté Agroécologie

Côté Fermentation

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 
  • La Halle de Technologie de Sayens à Dijon : accompagnement des entreprises dans leur démarche d’innovation, depuis l’idée jusqu’à l’industrialisation sur les thématiques suivantes :
    • Valorisation des Bio Ressources
    • Stabilité des aliments
    • Modification des propriétés techno-fonctionnelles des ingrédients par le procédé
    • Analyses sensorielles
  • Plateforme Biotech’Innov de Sayens à Dijon : plateforme dédiée à la compréhension des mécanismes biologiques et physico-chimiques du développement des micro-organismes, optimisation des bioprocédés, depuis la recherche laboratoire jusqu’à l’échelle pilote pour permettre leur industrialisation. Deux axes principaux :
    • Procédés de fermentation aérobie en milieu solide et liquide (plateau laboratoire)
    • Procédés de fermentation en anaérobiose en milieu liquide (plateau dédié au scaling-up des bioprocédés)
  • INNOVALIM Innovations alimentaires et culinaires (Besançon – Mamirolle – Poligny) : expertise sur les propriétés fonctionnelles et culinaires des ingrédients, mise au point de nouveaux produits avec prise en compte de l’effet procédé dans la démarche de développement, optimisation de procédés, gestion des qualités microbiologiques, chimiques, nutritionnelles, rhéologiques, organoleptiques et culinaires des matières premières et des produits transformés, analyses sensorielles et approche culinaire
  • CTCPA : accompagnement des entreprises dans les domaines de la conservation de la qualité et de la sécurité des aliments, le développement de produits et de procédés, la performance industrielle et environnementale et les emballages
  • Atelier Technologique Plombières : support privilégié d’apprentissage et de développement de compétences liées aux divers aspects du secteur agroalimentaire. Trois fonctions différentes : la pédagogie, la production et la commercialisation de produits transformés à partir de produits végétaux et la prestation de service pour les producteurs/agriculteurs du territoire qui souhaitent transformer leurs produits.
  • Bourgogne-Franche-Comté FROMEX : plateforme de recherche régionale rattachée à l’UMR PAM qui contribue à l’axe de recherche Alimentation, goût et sensorialité du centre INRAE Bourgogne-Franche-Comté :
    • Étudier les mécanismes de construction de la qualité des fromages et aliments fermentés
    • Développer des itinéraires technologiques innovants

Des clusters pour accompagner les projets

Vitagora

Pôle de compétitivité dédié à la filière agroalimentaire ainsi qu’aux offreurs de solutions transverses, Vitagora a pour mission de favoriser le développement, la performance industrielle, et l’innovation de ses membres.

 

Agronov

Cluster dédié à l’innovation en agroécologie, accompagne les entreprises et start-ups dans le développement de solutions agricoles durables

Programmes et initiatives structurants

  • Ferments du Futur : programme national visant à accélérer l’innovation autour des ferments et des microbiotes, avec la contribution d’entreprises et laboratoires régionaux

Acteurs régionaux impliqués : INRAE, Institut Agro, Vitagora, Bel, Eurogerm, l’Atelier du Fruit, Fungu’it, Med Food Lab, …

 

 

  • FAIRCHAIN (Horizon 2020) : projet européen soutenant le développement de chaînes alimentaires intermédiaires, entre circuits courts et industrie agroalimentaire, pour renforcer la résilience des systèmes alimentaires régionaux

Acteurs régionaux impliqués : INRAE, ENILEA, Monts & Terroirs, …

 

  • Projet Nutriferments (2023-2025) : créer une nouvelle offre d’aliments fermentés végétaux à forte valeur ajoutée Nutrition-Santé

Objectif : mieux comprendre les microbes et leurs interactions avec d’autres organismes vivants afin de mieux les utiliser pour faire face aux problématiques mondiales actuelles.

Budget : 14 millions d’euros

Acteurs impliqués : plus de 250 chercheurs issus de laboratoires universitaires de l’uBE, de l’uMLP, de l’Institut Agro, des organismes nationaux de recherche avec l’INRAE et le CNRS, des CHU de Besançon et de Dijon Bourgogne ainsi que des entreprises locales.

L’AER BFC vous accompagne 

Amélie Dessolle Giordano

Amélie DESSOLLE GIORDANO,
Cheffe de projet Alimentation sera votre interlocutrice privilégiée au sein de l’AER BFC. Avec une formation spécialisée et de nombreuses années d’expérience dans l’agroalimentaire, elle saura vous accompagner au cours de toutes les étapes de votre projet pour la filière Agroécologie et Fermentation. Elle connaît l’écosystème régional dans sa globalité et travaille avec les entreprises, les centres de formation et les centres de recherche.

 

L’accompagnement proposé par l’AER BFC prend différentes formes :

  • Rencontres d’entreprises à enjeux, 
  • Participation à l’animation de l’écosystème, 
  • Prospection ciblée en France et à l’international, 
  • Ingénierie de projets d’entreprises, 
  • Ingénierie financière, 
  • Foncier et immobilier d’entreprise. 

06.32.83.92.52 – adessolle@aer-bfc.com